软件的配置文件对于备份工作来说也非常重要，配置文件中包含了任务的设置和任务的执行情况。对于”增量备份”来说，配置文件中的日志更为重要，它用来恢复”增量备份”的目录结构。

为了备份软件的配置文件，您可以在软件中建立一个任务来备份软件自己的配置文件，执行方式可以采用”单向同步”，源目录设置为软件配置文件所存放的路径。在Windows Vista及以上版本的操作系统中（包含Windows 7），软件的配置文件保存在”C:\ProgramData\FileGee”目录下。在其它诸如WindowsXP等操作系统中，软件的配置文件保存在”C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\FileGee”目录下。您可以通过运行”%ALLUSERSPROFILE%”来找到这个路径。

您还需要进行一些过滤设置，有些文件并不需要备份。如上图所示，您只需要备份安装路径下的Data(任务设置、执行情况)和Log(日志信息)这两个目录。

另外，您还需要过滤当前任务(用于备份配置文件的任务)本身的配置文件。如上图所示，过滤掉这些文件，不进行备份。上图文件路径中的’*’是通配符，代表任意字符串。数字代表任务的编号，您可以在菜单”工具”->”运行命令生成器”中获得。如下图所示，选中您备份配置文件的任务，然后按”生成”，下面就能看到任务的编号。

备份配置文件的任务，不要采用实时的模式，可以采用间隔执行或手动的方式。

软件重新安装后，只需要把备份的Data和Log目录复制到安装路径下即可。